Geeks (CDFs) automatizam a identificação de vírus.

Quem sabe assim alguém se anima a correr atras de uma iniciação científica mais tecnológica.

Joseph DeRisi, biólogo molecular e bioquímico e professor na Universidade da Califórnia desenhou uma nova alternativa para a detecção automática de vírus baseando-se em microarrays de DNA (também conhecidos como chips de DNA) e robótica. Sobre seu produto Joseph diz em sua entrevista para o New York Times onde li a notícia:

"Trata-se de uma lâmina de vidro onde imprimimos pequenos fragmentos de DNA de cada vírus já descoberto - cerca de 22.000 diferentes seqüências virais. Eu desenhei o robô que faz o chip. Então eu construí e escrevi o software para automatizá-lo. Eu sempre fui um sério nerd de computador assim como um biólogo. Agora é o momento certo para um cientista com a combinação de interesses."

"It’s a glass slide onto which we’ve printed little DNA fragments of every virus ever discovered — about 22,000 different viral sequences. I designed the robot that made the chip. I then built that robot and wrote all the software to automate it. I’ve always been a serious computer nerd, as well as a biologist. Now is really the right moment for a scientist with that combination of interests."

Bactéria produzindo lixo polimérico?

A empresa Genomatica alega possuir uma cepa de E. coli preparada para produzir 1,4 butanediol (BDO) bacteriano. A partir desta matriz poderiam sintetizar plásticos para diversas utilidades. A empresa aposta na alta do preço do petróleo que garantia a produção original de BDO para a produção de plásticos.
Vale a pena visitar o site deles e investigar suas tramóias.

foto e informações retiradas de:
http://dsc.discovery.com/news/2008/09/26/bacteria-plastic.html

Métodos de Pesquisa em Biologia

Imagens (não verossímeis) do último Congresso Internacional de Métodos de Pesquisa em Biologia, UEPG 2007 - palestra do Guru Marcahatma Pillegangi sobre o desaparecimento de agratóxicos dos solo sagrado utilizando a força da mente sã - sala lotada como sempre!

Abertas as inscrições para nosso congresso internacional da nossa disciplina da turma de Biologia bacharelado. O desafio é produzir o resumo do artigo que vocês estão elaborando em um texto com até 250 palavras. Lembrem-se de que este é um resumo um pouco diferente daquele que está sendo preparado para o artigo. Próxima aula teremos as instruções de confecção dos pôsteres e da apresentação oral. A gravata é obrigatória!

Ta aí. O Thiago ganhou a promoção do pastel. 1° comentário no Blog.

Comentários?

Aos leitores distraídos percebam que cada postagem do BLOG permite comentários. Estudantes, manifestem-se e concorram a azeitona da postel da cantina da val com um café queimado (quem sabe eu salvo vocês e ofereço um mate amargo decente).

Traquéia

Corte transversal da traquéia (aumento de 1000x e 400x respectivamente - hematoxilina eosina). O desenho reforça a silueta de uma das células do epitélio. Perceba a modificação de membrana da célula, os cílios que auxiliam na limpeza de muco secretado pelo próprio epitélio. As diferentes células que compõem este tecido organizam seus núcleos em posições diferentes simulando um epitélio pluriestratificado. A este tipo de organização chamamos de epitélio pseudoestratificado.

Intestino delgado

Corte de intestino delgado em aumento de 1000x (hematoxilina Eosina) evidenciando microvilosidade. Perceba as células de epitélio no quadro em destaque. Em cinza, no quadro, vemos o espaço do tecido conjuntivo e em azul o espaço da luz do intestino.

Pouco de histologia

Segue aqui algumas imagens captadas artesanalmente em modelo PostPunk durante a disciplina de Biologia Geral para Engenharia de alimentos (de hoje de manhã). É impossível não notar as edições toscas para indicar as estruturas. Observe acima a figura de um corte de pele grossa em aumento de 400x. A coloração é de Hematoxilina e Eosina e a preparação é do Laboratório de Histologia Animal da UEPG (obrigado prof. Márcia). A = células da camada germinativa da epiderme; B = células da camada granulosa da epiderme; C = células da camada espinhosa da epiderme; D = camada córnea da epiderme; E = parte de estrutura sebácea/pilosa ; F = espaço onde se localiza a lâmina basal, abaixo desta linha inicia-se o tecido conjuntivo.

Exobiologia?

Bactérias encontradas em uma mina antiga pode ser o link com organismos extra-terrestres.

http://environment.newscientist.com/article/dn14906-goldmine-bug-dna-may-be-key-to-alien-life.html

Engenharia de Alimentos

Eletromicrografia de varredura mostrando bacilos de Clostridium botulinum (coloração da imagem por computador).

Há algum tempo o Fantástico noticiou um frenesi sobre o consumo de mel por crianças menores de um ano. Já tinha me deparado com o assunto quando um casal amigo meu voltou dos EUA com a mesma preocupação. Alguns alunos vieram me consultar e discutir a questão (e olha que não eram do curso de engenharia de Alimentos!). Fui procurar as pesquisas citadas sobre o tema e encontrei uma boa referência que disponibilizo abaixo. Está disponível na íntegra no SCIELO.

RAGAZANI, Adriana Valim Ferreira et al . Esporos de Clostridium botulinum em mel comercializado no Estado de São Paulo e em outros Estados brasileiros. Cienc. Rural , Santa Maria, v. 38, n. 2, 2008 . Disponível em: . Acesso em: 07 2008. doi: 10.1590/S0103-84782008000200016.


A pesquisa apresenta 7% de contaminação em 100 amostra. Perguntas para aquecer o debate seriam:
a) o número amostral é significativo para um levantamento estadual?
b) conhecer a procedência reduz a possibilidade de infecção?
c) quais as medidas profiláticas alternativas para o produtor?
d) estas medidas estão contempladas nas APPCC (Análise de Pontos Críticos na Produção de Alimentos)?

Tenho uma grande amizade com a família do Engenheiro Agrônomo Sr. Paulo Gustavo Sommer da Apisommer conhecido internacionalmente pela tradição e qualidade de seus produtos. Além de produtor, Sr. Sommer é um pesquisador entusiasta. Tenho a certeza de que uma conversa com ele expandiria o assunto. Interessados arregassem as mangas e conversem comigo.

Algum interessado em levar este assunto adiante em uma iniciação científica?

Atenção Zootecnistas!

O trabalho que estamos realizando é a preparação de um seminário que proporcione uma ilustração das aplicações diretas da disciplina no dia a dia do zootecnista.

A aula de 07/10 continuará o espaço de redação do trabalho e preparação.
Lembre-se de que uma resenha escrita deverá ser entregue na data de apresentação. Também fique esperto porque as equipes serão sorteadas à partir de 14/10, ou seja, nesta terça 3 ou 4 equipes irão apresentar seu trabalho, só não sabemos quais (então venha pronto para apresentar dia 14 a não ser que queira contar com a sorte de não ser sorteado).

Estou esperando a confirmação do 1/2 carneiro que vocês prometeram para o churrasco!

Métodos de Pesquisa em Biologia

Atenção para os prazos estipulados. Estou recebendo os trabalhos via e-mail (apresentado em aula, cheque comigo se está em dúvida) e publicando as edições e sugestões via Google docs. Você terá de fazer (se já não tiver) um login para o google (quem tem orkut geralmente tem login Google). Explore as possibilidades do Google docs!
http://docs.google.com/support/bin/topic.py?topic=15114
Somente 4 artigos foram entregues, porém, excelentes artigos! Não tenho dúvidas de que todos eles tem todas as qualidades para renderem a publicação.

22/09 - Entrega de Introdução e esboço de Material e métodos.
06/10 - Entraga de Introdução; Material e Métodos e Referências Bibliográficas
13/10 - Incluir Res. e Discussão.
A partir desta data seguem entregas de reescritas e indicações do professor para cada equipe.

Mestrado Biologia Evolutiva UEPG

Logo inicio a disciplina de dá seqüência à disciplina da Prof. Rosângela C. Tardivo e Prof. Cláudio H. Zawadzk de Fundamentos Sistemática Filogenética. Na seqüência aprofundamos critérios de análises de caracteres, discutimos a validade de conjunção de diferentes conjuntos dados e alternativas para tanto, estudamos técnicas de exploração de dados, e bioinformática (não tecnicista-tutorialista-macaquista). Outras discussões essenciais aparecerão a partir destes pilares mestres. Maiores informações na página do curso:
http://www.uepg.br/mestrados/mestradobiologia/

Onde está o Frontispício?

Inicio hoje o espaço do Blog que utilizarei para a desorganização de minhas disciplinas. Meus estudantes bem sabem que minha aula têm um pouco de complexo de rendeira. Caminhamos como um tecelão estabelecendo conexões diversas. O movimento é espiral em torno de um tema central e o movimento de micro-macro é obrigatório para quem aceita nossos desafios de aprender. Este espaço é uma forma de investigar os meandros de nossas possibilidades. Espero que aqueles que se sentem desafiados em ir além estejam passeando uma hora ou outra por aqui, são sempre muito bem vindos!

“Quando nos deparamos com a entrada de uma caverna, somos tomados por um sentimento misto de temor e desejo: temor das trevas, do desconhecido, e desejo de encontrar ali as chaves de mistérios sequer suspeitados.” Leonardo Da Vinci